| Istilah | Arti |
|---|---|
| Alzheimer's | Penyakit otak yang ditandai plak dan kusut saraf, dan video ini menunjukkan cara membalik rangkaian penyebabnya. |
| cholesterol | Jenis lemak dalam tubuh yang pengangkutannya ke pembentuk myelin terganggu pada Alzheimer dan bisa dipulihkan. |
| foundation model | Model AI berukuran besar yang dilatih dengan data luas lalu dipakai ulang untuk banyak tugas, termasuk analisis gambar dan biologi. |
| autoencoder | Jaringan saraf yang memampatkan data ke lapisan sempit lalu mengembalikannya, dipakai untuk mempelajari pola ekspresi gen di sel. |
| expression | Tingkat keaktifan sebuah gen yang diukur lewat jumlah mRNA di dalam sel, dihitung untuk jutaan sel dalam kuliah ini. |
| DNA | Molekul pembawa informasi genetik yang tersusun dari huruf A, C, G, dan T, dan urutannya dipelajari model AI dalam kuliah ini. |
| protein | Molekul besar yang tersusun dari asam amino dan melipat menjadi bentuk tertentu, yang menentukan fungsinya di dalam tubuh. |
| electronic health | Rekam medis digital pasien, berisi hasil tes dan diagnosis, yang dianalisis bersama data genetik untuk mencari pola penyakit. |
| histopathology | Pemeriksaan jaringan tubuh di bawah mikroskop untuk menentukan jenis penyakit, misalnya letak tumor pada gambar slide. |
| genomics | Studi tentang seluruh rangkaian DNA suatu organisme, yang dalam kuliah ini dipelajari dengan model AI untuk memahami mutasi. |
| myelin | Selubung lemak yang melindungi serabut saraf, dan pemulihannya dalam penelitian ini mengembalikan fungsi kognitif pada tikus. |
| genetic | Berkaitan dengan gen dan pewarisan sifat, dan dalam kuliah ini data genetik dipakai untuk mencari penyebab penyakit. |
Video ini berisi kuliah dari Manolis, profesor MIT yang meneliti genomika komputasi dan AI untuk biologi, dalam kelas MIT 6.S087 tentang Foundation Models dan AI generatif. Tujuannya adalah memakai AI untuk memahami mekanisme biologi manusia, lalu menggunakannya untuk mengembangkan terapi baru yang bisa mengatasi penyakit. Manolis menjelaskan tiga pergeseran besar di bidang ini: dari hipotesis ke data dalam jumlah besar, dari sekadar korelasi ke sebab-akibat lewat genetika, dan dari metode statistik khusus untuk setiap masalah ke model besar dengan miliaran parameter. Ia juga menyebut bahwa pendekatan ini sudah diterapkan pada lebih dari selusin penyakit, mulai dari penyakit jantung, obesitas, dan kanker hingga Alzheimer. Inti pesannya, kombinasi data genetik dan model besar dapat menjelaskan mekanisme penyakit, bukan hanya mencatat hubungannya.
Contoh konkret dalam kuliah mencakup model jaringan saraf konvolusional yang membaca pola urutan DNA untuk memprediksi gen mana yang aktif atau ditekan. Pada obesitas, pengubahan satu huruf DNA di wilayah pengatur membuat sel yang menyimpan lemak berubah menjadi membakar lemak, dan tikus yang salah satu gennya dimatikan tidak bisa bertambah berat meski diberi diet tinggi lemak. Pada Alzheimer, gangguan transpor kolesterol untuk membentuk myelin ditemukan sebagai penyebab, dan memulihkannya mengembalikan myelin serta kemampuan kognitif pada sel manusia dan tikus. Di imunoterapi kanker, sekitar 50 persen pasien merespons, dan dengan memahami rangkaiannya peneliti bisa memprediksi regulator hulu yang dapat dimatikan untuk mencegah kanker kembali. Untuk data besar, tim menganalisis sekitar dua juta sel dengan 20 ribu gen, meneliti 430 individu yang otaknya diperiksa setelah meninggal, dan melatih model histopatologi dengan 1,17 juta pasangan gambar dan teks.
Kata kunci
- Alzheimer's
- cholesterol
- foundation model
- autoencoder
- Mengikuti kuliah tamu Prof. Manolis Kellis dari MIT tentang genomika komputasi dan AI dalam biologi serta kedokteran.
- Membahas penyakit Alzheimer yang ditelusuri hingga kolesterol dan mielin, ekspresi gen, DNA, dan pola genetik pada data sel dan kesehatan elektronik.
- Memperlihatkan foundation model untuk histopatologi dari 1,17 juta pasangan gambar-teks, autoencoder untuk memprediksi pola ekspresi, serta pandangan bahwa sebagian besar ruang biologi mungkin terjangkau model yang ada.
Tulis catatan pribadimu untuk video ini. Catatan tersimpan di akunmu dan bisa dibuka dari perangkat mana pun.